Лишь знание прочих анатомических особенностей и филогенетических отношений рассматриваемых групп позволяет определять полярность эволюционных изменений на каждом отрезке истории.
Соответствие другим признакам
Нередко полагают, что если некий признак встречается у организма, обладающего в целом большим числом примитивных черт, то и данный признак тоже примитивный. Однако известно множество примеров ошибочности подобного предположения. Так, простирание хорды у ланцетника далеко вперед, по всей вероятности, не примитивное для позвоночных состояние, хотя многие другие признаки этого организма, несомненно, примитивны.
Анатомическая прогрессия
Известно, что некоторые структурные морфо- клины обычно имеют только одну направленность, хотя конкретные палеонтологические, онтогенетические или полученные методом межгруппового сравнения доказательства этой их особенности отсутствуют. Утраченные конечности практически никогда не возникают вновь. Утрата пальцев, утрата или срастание костей запястья и предплюсны распространены гораздо шире, чем обратные преобразования, хотя полидактилия и полифалангия - обычные производные признаки водных групп. Наличие множества крестцовых ребер-в общем производный признак по отношению к присутствию лишь одной их пары, однако у форм, вторично приспособившихся к жизни в воде, может происходить и их редукция.
Ни один метод установления полярности нельзя признать универсальным, поэтому всегда следует искать подтверждения полученным результатам, используя альтернативные критерии.
Кладограммы
Эволюционную историю позвоночных уже давно иллюстрируют филогенетическими деревьями. Горизонтальная ось отражает относительную анатомическую разницу между таксонами, а вертикальная - распределение последних во времени. Филогенетическое дерево может учитывать широкий набор анатомических, поведенческих и физиологических параметров, но редко дает представление о конкретных признаках, использованных для установления родства.
Особое внимание к производным признакам привело к появлению иного типа схемы родственных отношений-кладограммы, которая как раз и указывает, какими специализированными чертами обоснована монофилетическая природа каждой группы (рис.