Несмотря на отнесение к разным семействам, все три триасовых рода в основном сходны друг с другом. Рамфоринхоиды продолжали радиировать в течение всей юры и достигли наибольшего разнообразия в конце этого периода (Wellnhofer, 1975). Лучше всего известен позднеюрский род Rhamphorhynchus. Стержневидные зубы мелкой короткомордой формы Anurognathus предположительно свидетельствуют о питании насекомыми . Длинная морда и заостренные зубы Rhamphorhynchus, а также находки остатков рыб в зобу и желудке этого и других родов наводят на мысль, что многие птерозавры были рыбоядными. Прямые указания на особенности размножения птерозавров отсутствуют. Рамфоринхоидов, доживших до мелового периода, неизвестно.
Птеродактилоиды были многочисленны и разнообразны уже в верхней юре, о чем говорят ископаемые находки из Золенхофена (Wellnhofer, 1970). Эти остатки включают некоторых самых мелких птерозавров и предков крупнейших летающих позвоночных. Промежуточные между рамфоринхоидами и птеродактилоидами формы неизвестны , хотя все особенности скелета указывают на их близкое родство.

Рис. 168. Scleromochlus, Этот мелкий верхнетриасовый архозавр, возможно, родствен предкам птерозавров. Длина черепа примерно 30 мм (Padian, 1984)
Различия в пропорциях тела между двумя этими подотрядами, особенно сильная редукция хвоста у птеродактилоидов, вероятно, существенно влияли на особенности их полета (см. рис. 166). Наличие хвоста позади центра приложения подъемной силы способствует остойчивости. При этом, если скорость полета уменьшается, передняя часть тела автоматически поднимается и увеличивает угол атаки,
что способствует возрастанию подъемной силы. У самолетов остойчивость ведет к автоматической компенсации изменений направления и высоты, повышающей надежность полета, но снижающей маневренность. У истребителей остойчивость, насколько это возможно, снижают, чтобы они могли быстро менять направление движения. Среди птерозавров изменения пропорций тела, возможно, объясняются отбором на увеличение маневренности.