С начала девона две основные их группы-лучеперые и саркоптеригии - господствовали в морских и пресных водах. Для первых характерны множественные параллельные эндохондральные структуры, поддерживающие плавники, управляемые мускулами стенки тела, а также отсутствие эпихордальной лопасти хвостовою плавника.
Лучеперые подразделяются на две крупные группы: хрящевые ганоиды, радиация которых происходила преимущественно в девоне и карбоне, и не- оптеригии, появившиеся в конце палеозоя, широко радиировавшие в мезозое и раннем кайнозое; последние составляют подавляющее большинство современных рыб.
Центральный ствол палеозойских хрящевых ганоидов представляют палеонискообразные, бывшие одной из доминантных групп до раннего мезозоя включительно. Для них характерны толстые ганоидные чешуи, ярко выраженный гетероцеркальный хвост и членистые покровные лучи плавников. Их верхнечелюстная кость длинная, прочно связанная со щекой, тела позвонков не окостеневшие. До наших дней дожили две группы хрящевых ганоидов: многоперообразные и осетрообразные. Предки этих отрядов точно не установлены. От палеонискооб- разных произошли неоптеригии.
Эволюция лучеперых в мезозое отмечена прогрессивными изменениями в челюстях и гиоидном аппарате, увеличившими размер и скорость открывания ротоглоточной полости. Верхнечелюстная кость отделилась от щеки; появились три новые кости: надчелюстная, межкрышечная и симплекти- кум. Мозговая коробка преобразовалась так, что эффективность прикрепления глазных и эпаксиаль- ных мышц увеличилась. Последние, поднимая че
реп, открывают рот. Чешуи стали легче, а тела позвонков окостенели, что облегчило быстрое плаваний. Чем эффективнее обеспечивал плавательный пузырь нейтральную плавучесть, тем симметричнее становился хвост.
Эти изменения происходили в мезозое в нескольких различных филогенетических ветвях, от одной из которых произошли современные костистые рыбы. К другим линиям неоптеригий, распространенным в мезозое, относятся семионотиды, галекомор- фы, пикнодонты, макросемииды, пахикормиды и аспидоринхиды.